Geograafilise tähise kaitse seadus kehtib 10. jaanuarist 2000. Eesti ühinemisel Euroopa Liiduga jõustus muudatus, mille kohaselt ei hõlma riigisisene seadus enam neid põllumajandustoodete, toiduainete ning alkohoolsete jookide geograafilisi tähiseid, mis on kaitstavad Euroopa Liidu tasandil. Riigisiseselt on võimalik jätkuvalt kaitsta geograafilist tähist käsitööndusliku või tööstusliku päritoluga kaupade ja teenuste osas. 2022. aastal valmis Euroopa Komisjonil uue õigusakti ettepanek, mille jõustumisel saab kaitsta geograafilise tähisena ka käsitöönduslikult ja tööstuslikult valmistatavaid tooteid Euroopa Liidu tasandil. Uue akti jõustumisel jääb jätkuvalt võimalus taotleda riigisiseselt geograafilise tähise kaitset teenustele.
Euroopa Liidus reguleerivad geograafiliste tähiste õiguskaitset Euroopa Parlamendi ja nõukogu määrus (EL) 1308/2013, (EL) 251/2014 ja (EL) 1151/2012. Täiendavalt reguleerib piiritusjookide geograafilise tähise kaitset Euroopa Parlamendi ja nõukogu määrus (EL) 2019/787/. Nimetatud määruste alusel on registreeritud Eesti päritolu geograafilised tähised Estonian Vodka ja Sõir.
Geograafilise tähise kaitse seaduse kohaselt rakendatakse geograafilise tähise registreerimisel avaldus- ehk registreerimissüsteemi. Geograafiline tähis võib vormilt olla kas sõnaline või kujunduslik. Geograafilise tähise taotleja võib olla kauba tootja, töötleja, müügiks ettevalmistaja või teenuse osutaja, selliste isikute või tarbijate ühendus või kauba või teenuse päritoluriigi pädev ametiasutus. Geograafilise tähise õiguskaitse antakse geograafilise tähise registreerimisega riiklikus geograafiliste tähiste registris ja vastav teade avaldatakse Patendiameti ametlikus väljaandes.
Geograafilist tähist eristab muudest intellektuaalomandi õigustest see, et geograafilisel tähisel ei ole kindlat omanikku ja selle kaitse on tähtajatu. Kaitse eesmärk on tagada tootjate aus konkurents ja pakkuda tarbijatele usaldusväärset kindlate omadustega toodet. 2022. aastal ei esitatud Patendiametile ühtegi geograafilise tähise registreerimise taotlust. Riiklikus geograafiliste tähiste registris on 31. detsembri 2022 seisuga registreeritud kuus geograafilist tähist.